zamknij

Koronawirus w Rybniku. Informacje

Naukowcy z Politechniki Śląskiej pracują nad pokonaniem koronawirusa

Zneutralizować negatywne działanie koronawirusa – to zadanie, którego podjęło się wielu naukowców na świecie. Również grupa badawcza Tunneling Group, działająca przy Centrum Biotechnologii Politechniki Śląskiej próbuje coś z tym zrobić. Wykorzystując symulacje dynamiki molekularnej i autorskie oprogramowanie, dogłębnie poznali strukturę głównej proteazy wirusa SARS-CoV-2, enzymu, który jest jednym z kluczowych enzymów w cyklu życiowym wirusa.

Reklama

Naukowcy porównują wirusy

Młody zespół działający pod kierunkiem dra hab. Artura Góry z Centrum Biotechnologii Politechniki Śląskiej w ramach nawiązanej współpracy z badaczami z Uniwersytetu Alberty w Kanadzie oraz Politechniki w Turynie scharakteryzował główną proteazę SARS-CoV-2 (SARS-CoV-2 Mpro) oraz porównał ją z odpowiadającym enzymem wirusa wywołującego SARS (SARS-CoV Mpro). 

- Początkowo chcieliśmy porównać zachowanie obu enzymów i na tej podstawie zaproponować związki, które były już wcześniej przebadane i mogłyby szybko zostać wprowadzone, aby zahamować aktywność głównej proteazy, a tym samym zahamować namnażanie się wirusa. Niestety, już podczas wstępnych analiz okazało się, że kieszeń wiążąca substrat, w której miałoby następować wiązanie związków hamujących działanie enzymu, jest bardzo ruchliwa. Co oznacza, że nie możemy skorzystać z drogi na skróty - opowiada o wynikach badań dr hab. Artur Góra.

- Dodatkowo zaobserwowaliśmy, że nasz cel molekularny może łatwo ulec dalszym zmianom, gdyż charakteryzuje się dużą zmiennością ewolucyjną. To w efekcie oznaczałoby, że cały nasz i naszych Partnerów wysiłek może pójść na marne. Dlatego też niezwłocznie rozpoczęliśmy prace nad wytypowaniem innego - mniej ruchliwego i ewolucyjnie stabilnego - rejonu białka Mpro, do którego potencjalne leki mogłyby się wiązać skuteczniej – mówi dr hab. inż. Artur Góra.

Wygrac wyścig zbrojny z koronawirusem

Naukowcy wyjaśniają, że poprzez połączenie analizy dynamiki białka z analizą ewolucyjną oraz analizą wpływu dalszych mutacji na stabilność enzymu chcą wygrać ten szczególny rodzaj wyścig zbrojeń, inaczej mówiąc chcą przechytrzyć wirusa i przewidzieć kolejne możliwe drogi jego ewolucji.

- Już teraz wiemy, że wirus wyizolowany we Włoszech różni się od tego z Wuhan. Mutacje prowadzące do zmian w sekwencji głównej protazy to także tylko kwestia czasu i chcemy być na tę ewentualność dobrze przygotowani - mówi naukowiec. 

To nie tylko teoria

- Nasze prace nie są tylko i wyłącznie teoretyczne, skuteczność wiązania się wytypowanych związków możemy błyskawicznie sprawdzić dzięki nowoczesnej platformie do wysokoprzepustowej analizy interakcji międzycząsteczkowych dostarczonej przez firmę NanoTemper. Możemy mówić o dużym szczęściu w tej sytuacji, grant na pozyskanie unikalnej infrastruktury badawczej otrzymaliśmy pod koniec zeszłego roku i przy wykorzystaniu MonolithNT.Automated jesteśmy w stanie zweryfikować kilkaset związków dziennie - opowiada dr Góra. 

Prace w kierunku scharakteryzowania SARS-CoV-2 Mpro ruszyły w momencie, kiedy udostępniona została struktura krystalograficzna tego białka. Na jej podstawie wykonane zostały symulacje dynamiki molekularnej, które następnie przeanalizowano pod kątem zmian dynamiki i zachowania białka. Grupa Tunneling Group stworzyła program AQUA-DUCT, który pozwala na przeanalizowanie dynamiki zachowania białka z uwzględnieniem zmian w dostępnych przestrzeniach wewnątrzcząsteczkowych, co przy konwencjonalnej analizie jest zwykle pomijane. Dodatkowo, badania zostały rozszerzone o analizę ewolucyjną wirusowych białek Mpro oraz badanie stabilności białka. Pierwsze wyniki badań zespołu dra Góry zostały udostępnione dla wszystkich zainteresowanych już na początku marca, czekają również na recenzje w jednym z topowych czasopism.

W zespole badawczym z ramienia Politechniki Śląskiej pracują: dr hab. Artur Góra z Centrum Biotechnologii, doktorantki - mgr Karolina Mitusińska z Centrum Biotechnologii i Wydziału Chemicznego, mgr inż. Maria Bzówka ze Wspólnej Szkoły Doktorskiej, oraz inż. Agata Raczyńska i inż. Aleksandra Samol z Wydziału Automatyki, Elektroniki i Informatyki.

Oceń publikację: + 1 + 82 - 1 - 2

Obserwuj nasz serwis na:

Komentarze (7):
  • ~Franek7 2020-03-23 18:55:42

    To dobrze, że chociaż ktoś bo jak widać na nasz rząd nie ma co liczyć.

    34 45
  • ~Trop leminga 2020-03-23 19:09:58

    do franek lat 7 - przerażająca jest myśl o chaosie, o tym co by się teraz działo, gdyby u nas nadal rządzili ci nieudacznicy z PO-PSL, którzy nic pożytecznego nie robiąc w kraju, ze wszystkim czekali na wytyczne UE! Mielibyśmy niewyobrażalny chaos i tragedię wielu tysięcy chorych oraz setek umierających ludzi, dlatego teraz swoje „mądrości” i uszczypliwości, zachowując resztki godności przynajmniej przemilczcie i nie jątrzcie!

    54 43
  • ~grzegorz410 2020-03-23 19:50:49

    Franek o tym mówisz ?

    https://twitter.com/stanczykmaciej/status/1242044834405322753

    7 4
  • ~Franek7 2020-03-23 21:32:27

    Każda decyzja rządu jest albo błędna albo spóźniona. Najlepiej przeczytać ten tekst i wszystko stanie się jasne:

    https://wiadomosci.onet.pl/opinie/koronawirus-w-polsce-w-europie-jest-jeden-zly-scenariusz-epidemii-koronawirusa/p5y930s

    15 21
  • ~Jacek Kamiński 2020-03-23 22:23:37

    do trop leminga;
    Wówczas jako jedyni w Europie pochwalić się mogliśmy ciągłym wzrostem PKB. Zatem zachowaj resztki godności i nie jątrz (twe słowa), gdyż nie wiadomo jak "twoi" poradzą sobie z obecna sytuacją. Na razie dodrukowali 8 miliardów; czyli inflacja przyspieszy. To taki cichy podatek płacony przez społeczeństwo.

    18 12
  • ~Jan R. 2020-03-24 07:41:27

    Paniom i Panu życzę sukcesu w badaniach. Trzymam za Was kciuki!

    17 0
  • ~Jan R. 2020-03-24 08:08:33

    I jeszcze jedno. Nasze papelki, czyli pAD ostatnio bez przerwy włazi w buty premiera. Przed chwilą przełączyłem na inną stację radiową, bo jego 3,14....lenia nie mogę słuchać.

    7 5

Zamieszczone komentarze są prywatnymi opiniami Użytkowników portalu. Redakcja portalu Rybnik.com.pl nie ponosi odpowiedzialności za ich treść.

Alert Rybnik.com.pl

Byłeś świadkiem wypadku? W Twojej okolicy dzieje sie coś ciekawego? Chcesz opublikować recenzję z imprezy kulturalnej? Wciel się w rolę reportera Rybnik.com.pl i napisz nam o tym!

Wyślij alert

Sonda

Czy będziesz głosował 10 maja w wyborach prezydenckich?




Oddanych głosów: 1346